Protein–RNA interactions for Protein: Q62401

Ccl12, C-C motif chemokine 12, mousemouse

Predictions only

Length 104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl12Q62401 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ccl12Q62401 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl12Q62401 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl12Q62401 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccl12Q62401 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccl12Q62401 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccl12Q62401 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccl12Q62401 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl12Q62401 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccl12Q62401 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ccl12Q62401 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl12Q62401 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl12Q62401 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Ccl12Q62401 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Ccl12Q62401 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms