Protein–RNA interactions for Protein: Q62277

Syp, Synaptophysin, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SypQ62277 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SypQ62277 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SypQ62277 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SypQ62277 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SypQ62277 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SypQ62277 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SypQ62277 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SypQ62277 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SypQ62277 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SypQ62277 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SypQ62277 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SypQ62277 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SypQ62277 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SypQ62277 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SypQ62277 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SypQ62277 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SypQ62277 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SypQ62277 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SypQ62277 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SypQ62277 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SypQ62277 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SypQ62277 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SypQ62277 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SypQ62277 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SypQ62277 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SypQ62277 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SypQ62277 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SypQ62277 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SypQ62277 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SypQ62277 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SypQ62277 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SypQ62277 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SypQ62277 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SypQ62277 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SypQ62277 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SypQ62277 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SypQ62277 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SypQ62277 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SypQ62277 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SypQ62277 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SypQ62277 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SypQ62277 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SypQ62277 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SypQ62277 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SypQ62277 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
SypQ62277 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SypQ62277 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SypQ62277 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SypQ62277 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SypQ62277 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SypQ62277 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SypQ62277 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SypQ62277 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SypQ62277 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SypQ62277 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SypQ62277 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SypQ62277 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SypQ62277 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SypQ62277 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SypQ62277 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SypQ62277 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SypQ62277 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SypQ62277 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SypQ62277 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SypQ62277 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SypQ62277 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SypQ62277 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SypQ62277 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SypQ62277 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SypQ62277 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SypQ62277 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SypQ62277 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SypQ62277 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SypQ62277 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SypQ62277 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SypQ62277 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SypQ62277 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SypQ62277 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SypQ62277 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SypQ62277 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SypQ62277 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SypQ62277 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SypQ62277 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SypQ62277 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SypQ62277 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SypQ62277 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SypQ62277 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SypQ62277 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SypQ62277 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
SypQ62277 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
SypQ62277 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SypQ62277 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SypQ62277 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
SypQ62277 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SypQ62277 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SypQ62277 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SypQ62277 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SypQ62277 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SypQ62277 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SypQ62277 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.1 ms