Protein–RNA interactions for Protein: Q62148

Aldh1a2, Retinal dehydrogenase 2, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a2Q62148 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Aldh1a2Q62148 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Aldh1a2Q62148 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Aldh1a2Q62148 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Aldh1a2Q62148 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Aldh1a2Q62148 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Aldh1a2Q62148 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Aldh1a2Q62148 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Aldh1a2Q62148 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Aldh1a2Q62148 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aldh1a2Q62148 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Aldh1a2Q62148 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Aldh1a2Q62148 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Aldh1a2Q62148 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Aldh1a2Q62148 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aldh1a2Q62148 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aldh1a2Q62148 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Aldh1a2Q62148 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Aldh1a2Q62148 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Aldh1a2Q62148 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aldh1a2Q62148 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Aldh1a2Q62148 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Aldh1a2Q62148 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Aldh1a2Q62148 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Aldh1a2Q62148 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Aldh1a2Q62148 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Aldh1a2Q62148 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aldh1a2Q62148 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Aldh1a2Q62148 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Aldh1a2Q62148 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Aldh1a2Q62148 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aldh1a2Q62148 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aldh1a2Q62148 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Aldh1a2Q62148 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Aldh1a2Q62148 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aldh1a2Q62148 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Aldh1a2Q62148 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Aldh1a2Q62148 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Aldh1a2Q62148 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Aldh1a2Q62148 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aldh1a2Q62148 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Aldh1a2Q62148 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Aldh1a2Q62148 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Aldh1a2Q62148 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Aldh1a2Q62148 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Aldh1a2Q62148 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Aldh1a2Q62148 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.1 ms