Protein–RNA interactions for Protein: Q61500

Itm2a, Integral membrane protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itm2aQ61500 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itm2aQ61500 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Itm2aQ61500 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Itm2aQ61500 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Itm2aQ61500 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Itm2aQ61500 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Itm2aQ61500 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Itm2aQ61500 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Itm2aQ61500 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Itm2aQ61500 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Itm2aQ61500 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Itm2aQ61500 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itm2aQ61500 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Itm2aQ61500 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2aQ61500 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2aQ61500 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Itm2aQ61500 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Itm2aQ61500 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Itm2aQ61500 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Itm2aQ61500 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 244.3 ms