Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Cd53Q61451 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cd53Q61451 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd53Q61451 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd53Q61451 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cd53Q61451 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cd53Q61451 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cd53Q61451 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cd53Q61451 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Cd53Q61451 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd53Q61451 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Cd53Q61451 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Cd53Q61451 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd53Q61451 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd53Q61451 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cd53Q61451 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Cd53Q61451 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Cd53Q61451 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Cd53Q61451 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Cd53Q61451 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Cd53Q61451 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd53Q61451 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd53Q61451 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd53Q61451 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Cd53Q61451 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Cd53Q61451 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd53Q61451 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd53Q61451 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd53Q61451 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd53Q61451 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd53Q61451 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms