Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Foxd1Q61345 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Foxd1Q61345 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Foxd1Q61345 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Foxd1Q61345 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Foxd1Q61345 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Foxd1Q61345 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Foxd1Q61345 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Foxd1Q61345 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Foxd1Q61345 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Foxd1Q61345 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Foxd1Q61345 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Foxd1Q61345 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Foxd1Q61345 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Foxd1Q61345 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Foxd1Q61345 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Foxd1Q61345 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Foxd1Q61345 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Foxd1Q61345 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Foxd1Q61345 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Foxd1Q61345 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Foxd1Q61345 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Foxd1Q61345 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Foxd1Q61345 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Foxd1Q61345 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Foxd1Q61345 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Foxd1Q61345 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Foxd1Q61345 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Foxd1Q61345 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Foxd1Q61345 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Foxd1Q61345 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Foxd1Q61345 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Foxd1Q61345 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Foxd1Q61345 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Foxd1Q61345 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Foxd1Q61345 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Foxd1Q61345 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Foxd1Q61345 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Foxd1Q61345 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Foxd1Q61345 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Foxd1Q61345 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Foxd1Q61345 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Foxd1Q61345 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Foxd1Q61345 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Foxd1Q61345 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Foxd1Q61345 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Foxd1Q61345 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Foxd1Q61345 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Foxd1Q61345 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Foxd1Q61345 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Foxd1Q61345 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Foxd1Q61345 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Foxd1Q61345 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Foxd1Q61345 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Foxd1Q61345 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Foxd1Q61345 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Foxd1Q61345 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Foxd1Q61345 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Foxd1Q61345 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Foxd1Q61345 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Foxd1Q61345 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Foxd1Q61345 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Foxd1Q61345 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Foxd1Q61345 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Foxd1Q61345 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Foxd1Q61345 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Foxd1Q61345 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Foxd1Q61345 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Foxd1Q61345 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Foxd1Q61345 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Foxd1Q61345 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Foxd1Q61345 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms