Protein–RNA interactions for Protein: Q61221

Hif1a, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hif1aQ61221 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hif1aQ61221 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hif1aQ61221 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Hif1aQ61221 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hif1aQ61221 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hif1aQ61221 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hif1aQ61221 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Hif1aQ61221 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Hif1aQ61221 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hif1aQ61221 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hif1aQ61221 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hif1aQ61221 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hif1aQ61221 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hif1aQ61221 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Hif1aQ61221 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Hif1aQ61221 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Hif1aQ61221 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Hif1aQ61221 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hif1aQ61221 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Hif1aQ61221 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hif1aQ61221 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Hif1aQ61221 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hif1aQ61221 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hif1aQ61221 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hif1aQ61221 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hif1aQ61221 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hif1aQ61221 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hif1aQ61221 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hif1aQ61221 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hif1aQ61221 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms