Protein–RNA interactions for Protein: Q61107

Gbp4, Guanylate-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp4Q61107 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gbp4Q61107 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gbp4Q61107 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gbp4Q61107 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gbp4Q61107 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gbp4Q61107 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gbp4Q61107 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gbp4Q61107 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gbp4Q61107 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gbp4Q61107 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gbp4Q61107 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gbp4Q61107 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gbp4Q61107 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gbp4Q61107 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gbp4Q61107 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gbp4Q61107 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Gbp4Q61107 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Gbp4Q61107 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gbp4Q61107 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gbp4Q61107 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Gbp4Q61107 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Gbp4Q61107 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Gbp4Q61107 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gbp4Q61107 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Gbp4Q61107 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Gbp4Q61107 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Gbp4Q61107 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Gbp4Q61107 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Gbp4Q61107 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Gbp4Q61107 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gbp4Q61107 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gbp4Q61107 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms