Protein–RNA interactions for Protein: Q60952

Cep250, Centrosome-associated protein CEP250, mousemouse

Predictions only

Length 2,414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep250Q60952 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cep250Q60952 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep250Q60952 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cep250Q60952 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cep250Q60952 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cep250Q60952 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cep250Q60952 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cep250Q60952 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cep250Q60952 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cep250Q60952 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep250Q60952 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cep250Q60952 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cep250Q60952 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cep250Q60952 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep250Q60952 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cep250Q60952 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cep250Q60952 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cep250Q60952 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cep250Q60952 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep250Q60952 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cep250Q60952 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep250Q60952 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep250Q60952 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cep250Q60952 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep250Q60952 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Cep250Q60952 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cep250Q60952 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cep250Q60952 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cep250Q60952 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cep250Q60952 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep250Q60952 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cep250Q60952 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep250Q60952 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep250Q60952 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep250Q60952 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cep250Q60952 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms