Protein–RNA interactions for Protein: Q60841

Reln, Reelin, mousemouse

Predictions only

Length 3,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelnQ60841 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RelnQ60841 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RelnQ60841 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RelnQ60841 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RelnQ60841 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RelnQ60841 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RelnQ60841 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
RelnQ60841 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RelnQ60841 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RelnQ60841 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RelnQ60841 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RelnQ60841 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RelnQ60841 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RelnQ60841 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RelnQ60841 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.2■■□□□ 1.31
RelnQ60841 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
RelnQ60841 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RelnQ60841 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelnQ60841 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelnQ60841 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelnQ60841 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RelnQ60841 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RelnQ60841 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RelnQ60841 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RelnQ60841 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RelnQ60841 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RelnQ60841 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
RelnQ60841 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RelnQ60841 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RelnQ60841 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RelnQ60841 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RelnQ60841 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RelnQ60841 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RelnQ60841 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RelnQ60841 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RelnQ60841 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RelnQ60841 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelnQ60841 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RelnQ60841 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RelnQ60841 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RelnQ60841 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RelnQ60841 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RelnQ60841 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RelnQ60841 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RelnQ60841 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RelnQ60841 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RelnQ60841 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms