Protein–RNA interactions for Protein: Q60611

Satb1, DNA-binding protein SATB1, mousemouse

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Satb1Q60611 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Satb1Q60611 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Satb1Q60611 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Satb1Q60611 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Satb1Q60611 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Satb1Q60611 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Satb1Q60611 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Satb1Q60611 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Satb1Q60611 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Satb1Q60611 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Satb1Q60611 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Satb1Q60611 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Satb1Q60611 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Satb1Q60611 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Satb1Q60611 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Satb1Q60611 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Satb1Q60611 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Satb1Q60611 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Satb1Q60611 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Satb1Q60611 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Satb1Q60611 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Satb1Q60611 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Satb1Q60611 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Satb1Q60611 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Satb1Q60611 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Satb1Q60611 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Satb1Q60611 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Satb1Q60611 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Satb1Q60611 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Satb1Q60611 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Satb1Q60611 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Satb1Q60611 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Satb1Q60611 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Satb1Q60611 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Satb1Q60611 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Satb1Q60611 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Satb1Q60611 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Satb1Q60611 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Satb1Q60611 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Satb1Q60611 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Satb1Q60611 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Satb1Q60611 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Satb1Q60611 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Satb1Q60611 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Satb1Q60611 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Satb1Q60611 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms