Protein–RNA interactions for Protein: Q5U465

Ccdc125, Coiled-coil domain-containing protein 125, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc125Q5U465 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Ccdc125Q5U465 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc125Q5U465 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ccdc125Q5U465 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc125Q5U465 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc125Q5U465 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc125Q5U465 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc125Q5U465 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc125Q5U465 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Ccdc125Q5U465 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ccdc125Q5U465 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc125Q5U465 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc125Q5U465 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccdc125Q5U465 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc125Q5U465 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc125Q5U465 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc125Q5U465 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc125Q5U465 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms