Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWW4

Med13, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 2,171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med13Q5SWW4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Med13Q5SWW4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Med13Q5SWW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med13Q5SWW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med13Q5SWW4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med13Q5SWW4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Med13Q5SWW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Med13Q5SWW4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Med13Q5SWW4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Med13Q5SWW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Med13Q5SWW4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Med13Q5SWW4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Med13Q5SWW4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Med13Q5SWW4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med13Q5SWW4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Med13Q5SWW4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Med13Q5SWW4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Med13Q5SWW4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Med13Q5SWW4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Med13Q5SWW4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Med13Q5SWW4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Med13Q5SWW4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Med13Q5SWW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Med13Q5SWW4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med13Q5SWW4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Med13Q5SWW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med13Q5SWW4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Med13Q5SWW4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med13Q5SWW4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med13Q5SWW4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Med13Q5SWW4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Med13Q5SWW4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Med13Q5SWW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Med13Q5SWW4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Med13Q5SWW4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Med13Q5SWW4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Med13Q5SWW4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Med13Q5SWW4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Med13Q5SWW4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Med13Q5SWW4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Med13Q5SWW4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Med13Q5SWW4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Med13Q5SWW4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Med13Q5SWW4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Med13Q5SWW4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Med13Q5SWW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Med13Q5SWW4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Med13Q5SWW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.8 ms