Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc42Q5SV66 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Ccdc42Q5SV66 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc42Q5SV66 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc42Q5SV66 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc42Q5SV66 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc42Q5SV66 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ccdc42Q5SV66 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc42Q5SV66 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc42Q5SV66 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc42Q5SV66 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc42Q5SV66 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc42Q5SV66 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc42Q5SV66 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc42Q5SV66 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc42Q5SV66 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc42Q5SV66 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc42Q5SV66 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ccdc42Q5SV66 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc42Q5SV66 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc42Q5SV66 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc42Q5SV66 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc42Q5SV66 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc42Q5SV66 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc42Q5SV66 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc42Q5SV66 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc42Q5SV66 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc42Q5SV66 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc42Q5SV66 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc42Q5SV66 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ccdc42Q5SV66 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc42Q5SV66 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms