Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSH8

Cyb5d2, Neuferricin, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb5d2Q5SSH8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyb5d2Q5SSH8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyb5d2Q5SSH8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cyb5d2Q5SSH8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cyb5d2Q5SSH8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cyb5d2Q5SSH8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cyb5d2Q5SSH8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cyb5d2Q5SSH8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb5d2Q5SSH8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb5d2Q5SSH8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cyb5d2Q5SSH8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyb5d2Q5SSH8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cyb5d2Q5SSH8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cyb5d2Q5SSH8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cyb5d2Q5SSH8 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cyb5d2Q5SSH8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyb5d2Q5SSH8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cyb5d2Q5SSH8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyb5d2Q5SSH8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cyb5d2Q5SSH8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cyb5d2Q5SSH8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cyb5d2Q5SSH8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cyb5d2Q5SSH8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyb5d2Q5SSH8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cyb5d2Q5SSH8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cyb5d2Q5SSH8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cyb5d2Q5SSH8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyb5d2Q5SSH8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cyb5d2Q5SSH8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyb5d2Q5SSH8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cyb5d2Q5SSH8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cyb5d2Q5SSH8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyb5d2Q5SSH8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cyb5d2Q5SSH8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cyb5d2Q5SSH8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyb5d2Q5SSH8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyb5d2Q5SSH8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cyb5d2Q5SSH8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cyb5d2Q5SSH8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms