Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttf2Q5NC05 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttf2Q5NC05 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttf2Q5NC05 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttf2Q5NC05 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Ttf2Q5NC05 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttf2Q5NC05 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttf2Q5NC05 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttf2Q5NC05 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ttf2Q5NC05 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttf2Q5NC05 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttf2Q5NC05 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttf2Q5NC05 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttf2Q5NC05 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttf2Q5NC05 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttf2Q5NC05 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ttf2Q5NC05 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Ttf2Q5NC05 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ttf2Q5NC05 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ttf2Q5NC05 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ttf2Q5NC05 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ttf2Q5NC05 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ttf2Q5NC05 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms