Protein–RNA interactions for Protein: Q5NBU5

Fbxo39, F-box only protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo39Q5NBU5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Fbxo39Q5NBU5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fbxo39Q5NBU5 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fbxo39Q5NBU5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fbxo39Q5NBU5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fbxo39Q5NBU5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fbxo39Q5NBU5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fbxo39Q5NBU5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Fbxo39Q5NBU5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbxo39Q5NBU5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fbxo39Q5NBU5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Fbxo39Q5NBU5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbxo39Q5NBU5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Fbxo39Q5NBU5 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fbxo39Q5NBU5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fbxo39Q5NBU5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Fbxo39Q5NBU5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Fbxo39Q5NBU5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fbxo39Q5NBU5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fbxo39Q5NBU5 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fbxo39Q5NBU5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Fbxo39Q5NBU5 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fbxo39Q5NBU5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fbxo39Q5NBU5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fbxo39Q5NBU5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fbxo39Q5NBU5 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fbxo39Q5NBU5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Fbxo39Q5NBU5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fbxo39Q5NBU5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms