Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Taf3Q5HZG4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Taf3Q5HZG4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Taf3Q5HZG4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Taf3Q5HZG4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Taf3Q5HZG4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Taf3Q5HZG4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Taf3Q5HZG4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Taf3Q5HZG4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Taf3Q5HZG4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Taf3Q5HZG4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Taf3Q5HZG4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Taf3Q5HZG4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Taf3Q5HZG4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Taf3Q5HZG4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Taf3Q5HZG4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Taf3Q5HZG4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Taf3Q5HZG4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Taf3Q5HZG4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Taf3Q5HZG4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Taf3Q5HZG4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Taf3Q5HZG4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Taf3Q5HZG4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Taf3Q5HZG4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf3Q5HZG4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf3Q5HZG4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf3Q5HZG4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Taf3Q5HZG4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Taf3Q5HZG4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Taf3Q5HZG4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Taf3Q5HZG4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Taf3Q5HZG4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Taf3Q5HZG4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Taf3Q5HZG4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Taf3Q5HZG4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Taf3Q5HZG4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Taf3Q5HZG4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Taf3Q5HZG4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Taf3Q5HZG4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Taf3Q5HZG4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Taf3Q5HZG4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Taf3Q5HZG4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Taf3Q5HZG4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1390.2 ms