Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SynaQ5G5D5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SynaQ5G5D5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SynaQ5G5D5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SynaQ5G5D5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SynaQ5G5D5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SynaQ5G5D5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SynaQ5G5D5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SynaQ5G5D5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SynaQ5G5D5 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynaQ5G5D5 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SynaQ5G5D5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SynaQ5G5D5 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SynaQ5G5D5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SynaQ5G5D5 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SynaQ5G5D5 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynaQ5G5D5 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynaQ5G5D5 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SynaQ5G5D5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SynaQ5G5D5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SynaQ5G5D5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SynaQ5G5D5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SynaQ5G5D5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SynaQ5G5D5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
SynaQ5G5D5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SynaQ5G5D5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynaQ5G5D5 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SynaQ5G5D5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SynaQ5G5D5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynaQ5G5D5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynaQ5G5D5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynaQ5G5D5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SynaQ5G5D5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SynaQ5G5D5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SynaQ5G5D5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynaQ5G5D5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SynaQ5G5D5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SynaQ5G5D5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynaQ5G5D5 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SynaQ5G5D5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SynaQ5G5D5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynaQ5G5D5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SynaQ5G5D5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SynaQ5G5D5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynaQ5G5D5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SynaQ5G5D5 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynaQ5G5D5 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynaQ5G5D5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SynaQ5G5D5 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SynaQ5G5D5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynaQ5G5D5 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SynaQ5G5D5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SynaQ5G5D5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SynaQ5G5D5 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SynaQ5G5D5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SynaQ5G5D5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms