Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
L1td1Q587J6 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
L1td1Q587J6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
L1td1Q587J6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
L1td1Q587J6 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
L1td1Q587J6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
L1td1Q587J6 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
L1td1Q587J6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
L1td1Q587J6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
L1td1Q587J6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1td1Q587J6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
L1td1Q587J6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
L1td1Q587J6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
L1td1Q587J6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
L1td1Q587J6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC27.57■■■□□ 2
L1td1Q587J6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1td1Q587J6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
L1td1Q587J6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
L1td1Q587J6 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.54■■■□□ 2
L1td1Q587J6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
L1td1Q587J6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
L1td1Q587J6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
L1td1Q587J6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1td1Q587J6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1td1Q587J6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
L1td1Q587J6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
L1td1Q587J6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
L1td1Q587J6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
L1td1Q587J6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1td1Q587J6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
L1td1Q587J6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
L1td1Q587J6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1td1Q587J6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
L1td1Q587J6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1td1Q587J6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
L1td1Q587J6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1td1Q587J6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1td1Q587J6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
L1td1Q587J6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
L1td1Q587J6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
L1td1Q587J6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
L1td1Q587J6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms