Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
WhammQ571B6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
WhammQ571B6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
WhammQ571B6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
WhammQ571B6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
WhammQ571B6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WhammQ571B6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
WhammQ571B6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
WhammQ571B6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WhammQ571B6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WhammQ571B6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
WhammQ571B6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
WhammQ571B6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
WhammQ571B6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
WhammQ571B6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
WhammQ571B6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WhammQ571B6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
WhammQ571B6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
WhammQ571B6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
WhammQ571B6 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
WhammQ571B6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
WhammQ571B6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
WhammQ571B6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
WhammQ571B6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
WhammQ571B6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms