Protein–RNA interactions for Protein: Q52KH6

Gm14685, DNA segment, Chr X, Baylor 18, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm14685Q52KH6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm14685Q52KH6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Gm14685Q52KH6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Gm14685Q52KH6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm14685Q52KH6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Gm14685Q52KH6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Gm14685Q52KH6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm14685Q52KH6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Gm14685Q52KH6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Gm14685Q52KH6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Gm14685Q52KH6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Gm14685Q52KH6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Gm14685Q52KH6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Gm14685Q52KH6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm14685Q52KH6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Gm14685Q52KH6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Gm14685Q52KH6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Gm14685Q52KH6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Gm14685Q52KH6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Gm14685Q52KH6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Gm14685Q52KH6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Gm14685Q52KH6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Gm14685Q52KH6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Gm14685Q52KH6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Gm14685Q52KH6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms