Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL25

Lhfpl5, LHFPL tetraspan subfamily member 5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl5Q4KL25 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Lhfpl5Q4KL25 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhfpl5Q4KL25 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhfpl5Q4KL25 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Lhfpl5Q4KL25 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lhfpl5Q4KL25 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Lhfpl5Q4KL25 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Lhfpl5Q4KL25 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms