Protein–RNA interactions for Protein: Q4ACU6

Shank3, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,730 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shank3Q4ACU6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
Shank3Q4ACU6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Shank3Q4ACU6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Shank3Q4ACU6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Shank3Q4ACU6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Shank3Q4ACU6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Shank3Q4ACU6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.92
Shank3Q4ACU6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Shank3Q4ACU6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Shank3Q4ACU6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Shank3Q4ACU6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
Shank3Q4ACU6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Shank3Q4ACU6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Shank3Q4ACU6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Shank3Q4ACU6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Shank3Q4ACU6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Shank3Q4ACU6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Shank3Q4ACU6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Shank3Q4ACU6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Shank3Q4ACU6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Shank3Q4ACU6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Shank3Q4ACU6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Shank3Q4ACU6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Shank3Q4ACU6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Shank3Q4ACU6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Shank3Q4ACU6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
Shank3Q4ACU6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
Shank3Q4ACU6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Shank3Q4ACU6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Shank3Q4ACU6 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Shank3Q4ACU6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
Shank3Q4ACU6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Shank3Q4ACU6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Shank3Q4ACU6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Shank3Q4ACU6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Shank3Q4ACU6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Shank3Q4ACU6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
Shank3Q4ACU6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Shank3Q4ACU6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
Shank3Q4ACU6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Shank3Q4ACU6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Shank3Q4ACU6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Shank3Q4ACU6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Shank3Q4ACU6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Shank3Q4ACU6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Shank3Q4ACU6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Shank3Q4ACU6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Shank3Q4ACU6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Shank3Q4ACU6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Shank3Q4ACU6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Shank3Q4ACU6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Shank3Q4ACU6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
Shank3Q4ACU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Shank3Q4ACU6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Shank3Q4ACU6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Shank3Q4ACU6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Shank3Q4ACU6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Shank3Q4ACU6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Shank3Q4ACU6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Shank3Q4ACU6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Shank3Q4ACU6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Shank3Q4ACU6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Shank3Q4ACU6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Shank3Q4ACU6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Shank3Q4ACU6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Shank3Q4ACU6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Shank3Q4ACU6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.81
Shank3Q4ACU6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Shank3Q4ACU6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Shank3Q4ACU6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Shank3Q4ACU6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Shank3Q4ACU6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
Shank3Q4ACU6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Shank3Q4ACU6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Shank3Q4ACU6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms