Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3R4

Itga1, Integrin alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga1Q3V3R4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Itga1Q3V3R4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Itga1Q3V3R4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga1Q3V3R4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Itga1Q3V3R4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Itga1Q3V3R4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga1Q3V3R4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga1Q3V3R4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Itga1Q3V3R4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Itga1Q3V3R4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Itga1Q3V3R4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Itga1Q3V3R4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Itga1Q3V3R4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Itga1Q3V3R4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga1Q3V3R4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Itga1Q3V3R4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Itga1Q3V3R4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itga1Q3V3R4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itga1Q3V3R4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Itga1Q3V3R4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Itga1Q3V3R4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Itga1Q3V3R4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Itga1Q3V3R4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Itga1Q3V3R4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Itga1Q3V3R4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Itga1Q3V3R4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Itga1Q3V3R4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga1Q3V3R4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Itga1Q3V3R4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Itga1Q3V3R4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Itga1Q3V3R4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms