Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2W7

4930518I15Rik, RIKEN cDNA 4930518I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930518I15RikQ3V2W7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
4930518I15RikQ3V2W7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
4930518I15RikQ3V2W7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930518I15RikQ3V2W7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
4930518I15RikQ3V2W7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
4930518I15RikQ3V2W7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4930518I15RikQ3V2W7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms