Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2G4

BC030870, cDNA sequence BC030870, mousemouse

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Length 71 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC030870Q3V2G4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BC030870Q3V2G4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BC030870Q3V2G4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BC030870Q3V2G4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BC030870Q3V2G4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC030870Q3V2G4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BC030870Q3V2G4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BC030870Q3V2G4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BC030870Q3V2G4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BC030870Q3V2G4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC030870Q3V2G4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BC030870Q3V2G4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
BC030870Q3V2G4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BC030870Q3V2G4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC030870Q3V2G4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BC030870Q3V2G4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BC030870Q3V2G4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC030870Q3V2G4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BC030870Q3V2G4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BC030870Q3V2G4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BC030870Q3V2G4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BC030870Q3V2G4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BC030870Q3V2G4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BC030870Q3V2G4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BC030870Q3V2G4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
BC030870Q3V2G4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BC030870Q3V2G4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC030870Q3V2G4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC030870Q3V2G4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC030870Q3V2G4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BC030870Q3V2G4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC030870Q3V2G4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BC030870Q3V2G4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC030870Q3V2G4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BC030870Q3V2G4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
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