Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ulk4Q3V129 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ulk4Q3V129 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Ulk4Q3V129 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ulk4Q3V129 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ulk4Q3V129 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ulk4Q3V129 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ulk4Q3V129 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ulk4Q3V129 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ulk4Q3V129 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ulk4Q3V129 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ulk4Q3V129 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ulk4Q3V129 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Ulk4Q3V129 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Ulk4Q3V129 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ulk4Q3V129 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ulk4Q3V129 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Ulk4Q3V129 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Ulk4Q3V129 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ulk4Q3V129 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ulk4Q3V129 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ulk4Q3V129 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Ulk4Q3V129 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ulk4Q3V129 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ulk4Q3V129 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ulk4Q3V129 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ulk4Q3V129 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ulk4Q3V129 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ulk4Q3V129 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ulk4Q3V129 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ulk4Q3V129 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ulk4Q3V129 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Ulk4Q3V129 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ulk4Q3V129 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ulk4Q3V129 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Ulk4Q3V129 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ulk4Q3V129 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ulk4Q3V129 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ulk4Q3V129 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Ulk4Q3V129 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ulk4Q3V129 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ulk4Q3V129 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Ulk4Q3V129 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ulk4Q3V129 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ulk4Q3V129 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Ulk4Q3V129 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Ulk4Q3V129 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Ulk4Q3V129 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Ulk4Q3V129 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Ulk4Q3V129 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Ulk4Q3V129 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Ulk4Q3V129 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ulk4Q3V129 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Ulk4Q3V129 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Ulk4Q3V129 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms