Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc110Q3V125 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc110Q3V125 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Ccdc110Q3V125 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc110Q3V125 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc110Q3V125 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc110Q3V125 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc110Q3V125 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc110Q3V125 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc110Q3V125 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc110Q3V125 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc110Q3V125 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc110Q3V125 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc110Q3V125 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc110Q3V125 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc110Q3V125 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc110Q3V125 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc110Q3V125 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc110Q3V125 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms