Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
4930596D02RikQ3V0H9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4930596D02RikQ3V0H9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4930596D02RikQ3V0H9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
4930596D02RikQ3V0H9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms