Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY51

Lrrc55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc55Q3UY51 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Lrrc55Q3UY51 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lrrc55Q3UY51 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lrrc55Q3UY51 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Lrrc55Q3UY51 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc55Q3UY51 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lrrc55Q3UY51 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lrrc55Q3UY51 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc55Q3UY51 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lrrc55Q3UY51 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lrrc55Q3UY51 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lrrc55Q3UY51 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lrrc55Q3UY51 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lrrc55Q3UY51 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc55Q3UY51 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lrrc55Q3UY51 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc55Q3UY51 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lrrc55Q3UY51 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc55Q3UY51 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc55Q3UY51 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lrrc55Q3UY51 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lrrc55Q3UY51 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lrrc55Q3UY51 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lrrc55Q3UY51 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc55Q3UY51 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Lrrc55Q3UY51 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lrrc55Q3UY51 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms