Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2fbQ3UWQ3 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ube2fbQ3UWQ3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ube2fbQ3UWQ3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2fbQ3UWQ3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ube2fbQ3UWQ3 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ube2fbQ3UWQ3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube2fbQ3UWQ3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ube2fbQ3UWQ3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ube2fbQ3UWQ3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Ube2fbQ3UWQ3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2fbQ3UWQ3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ube2fbQ3UWQ3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2fbQ3UWQ3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ube2fbQ3UWQ3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ube2fbQ3UWQ3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ube2fbQ3UWQ3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ube2fbQ3UWQ3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ube2fbQ3UWQ3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ube2fbQ3UWQ3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2fbQ3UWQ3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ube2fbQ3UWQ3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2fbQ3UWQ3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2fbQ3UWQ3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ube2fbQ3UWQ3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ube2fbQ3UWQ3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ube2fbQ3UWQ3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ube2fbQ3UWQ3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ube2fbQ3UWQ3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ube2fbQ3UWQ3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ube2fbQ3UWQ3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ube2fbQ3UWQ3 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ube2fbQ3UWQ3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2fbQ3UWQ3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ube2fbQ3UWQ3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2fbQ3UWQ3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2fbQ3UWQ3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ube2fbQ3UWQ3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ube2fbQ3UWQ3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2fbQ3UWQ3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ube2fbQ3UWQ3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ube2fbQ3UWQ3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ube2fbQ3UWQ3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms