Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
D130052B06RikQ3UW13 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
D130052B06RikQ3UW13 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
D130052B06RikQ3UW13 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
D130052B06RikQ3UW13 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
D130052B06RikQ3UW13 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
D130052B06RikQ3UW13 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
D130052B06RikQ3UW13 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
D130052B06RikQ3UW13 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms