Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTH8

Arhgef9, Rho guanine nucleotide exchange factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef9Q3UTH8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arhgef9Q3UTH8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arhgef9Q3UTH8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgef9Q3UTH8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arhgef9Q3UTH8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgef9Q3UTH8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Arhgef9Q3UTH8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgef9Q3UTH8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgef9Q3UTH8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgef9Q3UTH8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgef9Q3UTH8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgef9Q3UTH8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgef9Q3UTH8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgef9Q3UTH8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Arhgef9Q3UTH8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Arhgef9Q3UTH8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms