Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BB287469Q3UT53 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BB287469Q3UT53 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BB287469Q3UT53 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BB287469Q3UT53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BB287469Q3UT53 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BB287469Q3UT53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BB287469Q3UT53 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
BB287469Q3UT53 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BB287469Q3UT53 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BB287469Q3UT53 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BB287469Q3UT53 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BB287469Q3UT53 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BB287469Q3UT53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BB287469Q3UT53 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BB287469Q3UT53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BB287469Q3UT53 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
BB287469Q3UT53 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BB287469Q3UT53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
BB287469Q3UT53 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
BB287469Q3UT53 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
BB287469Q3UT53 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms