Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc190Q3URK1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ccdc190Q3URK1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ccdc190Q3URK1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ccdc190Q3URK1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ccdc190Q3URK1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc190Q3URK1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ccdc190Q3URK1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc190Q3URK1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc190Q3URK1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ccdc190Q3URK1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ccdc190Q3URK1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ccdc190Q3URK1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ccdc190Q3URK1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc190Q3URK1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc190Q3URK1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc190Q3URK1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms