Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQI9

Mindy4, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-4, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy4Q3UQI9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Mindy4Q3UQI9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mindy4Q3UQI9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Mindy4Q3UQI9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mindy4Q3UQI9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mindy4Q3UQI9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mindy4Q3UQI9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mindy4Q3UQI9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mindy4Q3UQI9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Mindy4Q3UQI9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mindy4Q3UQI9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Mindy4Q3UQI9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Mindy4Q3UQI9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Mindy4Q3UQI9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mindy4Q3UQI9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Mindy4Q3UQI9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Mindy4Q3UQI9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Mindy4Q3UQI9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Mindy4Q3UQI9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Mindy4Q3UQI9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Mindy4Q3UQI9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Mindy4Q3UQI9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Mindy4Q3UQI9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mindy4Q3UQI9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Mindy4Q3UQI9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Mindy4Q3UQI9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Mindy4Q3UQI9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Mindy4Q3UQI9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Mindy4Q3UQI9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Mindy4Q3UQI9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Mindy4Q3UQI9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mindy4Q3UQI9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Mindy4Q3UQI9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Mindy4Q3UQI9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Mindy4Q3UQI9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Mindy4Q3UQI9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Mindy4Q3UQI9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Mindy4Q3UQI9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mindy4Q3UQI9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Mindy4Q3UQI9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mindy4Q3UQI9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Mindy4Q3UQI9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mindy4Q3UQI9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Mindy4Q3UQI9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Mindy4Q3UQI9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Mindy4Q3UQI9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms