Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL6

Ms4a15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a15Q3UPL6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a15Q3UPL6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a15Q3UPL6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms