Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL6

Ms4a15, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 15, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a15Q3UPL6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ms4a15Q3UPL6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ms4a15Q3UPL6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ms4a15Q3UPL6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ms4a15Q3UPL6 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ms4a15Q3UPL6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ms4a15Q3UPL6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ms4a15Q3UPL6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ms4a15Q3UPL6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ms4a15Q3UPL6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ms4a15Q3UPL6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ms4a15Q3UPL6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms