Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP38

Cracr2a, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cracr2aQ3UP38 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Cracr2aQ3UP38 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
Cracr2aQ3UP38 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Cracr2aQ3UP38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cracr2aQ3UP38 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cracr2aQ3UP38 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cracr2aQ3UP38 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Cracr2aQ3UP38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cracr2aQ3UP38 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Cracr2aQ3UP38 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Cracr2aQ3UP38 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cracr2aQ3UP38 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cracr2aQ3UP38 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cracr2aQ3UP38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cracr2aQ3UP38 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Cracr2aQ3UP38 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cracr2aQ3UP38 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cracr2aQ3UP38 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Cracr2aQ3UP38 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cracr2aQ3UP38 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Cracr2aQ3UP38 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Cracr2aQ3UP38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Cracr2aQ3UP38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Cracr2aQ3UP38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cracr2aQ3UP38 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cracr2aQ3UP38 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cracr2aQ3UP38 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cracr2aQ3UP38 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cracr2aQ3UP38 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cracr2aQ3UP38 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cracr2aQ3UP38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cracr2aQ3UP38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Cracr2aQ3UP38 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cracr2aQ3UP38 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Cracr2aQ3UP38 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cracr2aQ3UP38 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cracr2aQ3UP38 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cracr2aQ3UP38 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Cracr2aQ3UP38 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cracr2aQ3UP38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cracr2aQ3UP38 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cracr2aQ3UP38 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cracr2aQ3UP38 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cracr2aQ3UP38 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cracr2aQ3UP38 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Cracr2aQ3UP38 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cracr2aQ3UP38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cracr2aQ3UP38 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cracr2aQ3UP38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Cracr2aQ3UP38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms