Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ankrd27Q3UMR0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd27Q3UMR0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd27Q3UMR0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ankrd27Q3UMR0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ankrd27Q3UMR0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ankrd27Q3UMR0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd27Q3UMR0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd27Q3UMR0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd27Q3UMR0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ankrd27Q3UMR0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ankrd27Q3UMR0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd27Q3UMR0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ankrd27Q3UMR0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd27Q3UMR0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd27Q3UMR0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ankrd27Q3UMR0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ankrd27Q3UMR0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd27Q3UMR0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Ankrd27Q3UMR0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Ankrd27Q3UMR0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd27Q3UMR0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ankrd27Q3UMR0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ankrd27Q3UMR0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd27Q3UMR0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ankrd27Q3UMR0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ankrd27Q3UMR0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd27Q3UMR0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ankrd27Q3UMR0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd27Q3UMR0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd27Q3UMR0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ankrd27Q3UMR0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ankrd27Q3UMR0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd27Q3UMR0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ankrd27Q3UMR0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ankrd27Q3UMR0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ankrd27Q3UMR0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms