Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM18

Lsg1, Large subunit GTPase 1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 644 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsg1Q3UM18 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lsg1Q3UM18 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lsg1Q3UM18 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lsg1Q3UM18 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lsg1Q3UM18 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lsg1Q3UM18 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lsg1Q3UM18 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lsg1Q3UM18 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lsg1Q3UM18 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lsg1Q3UM18 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lsg1Q3UM18 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Lsg1Q3UM18 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lsg1Q3UM18 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lsg1Q3UM18 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lsg1Q3UM18 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lsg1Q3UM18 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lsg1Q3UM18 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lsg1Q3UM18 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lsg1Q3UM18 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsg1Q3UM18 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsg1Q3UM18 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsg1Q3UM18 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lsg1Q3UM18 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Lsg1Q3UM18 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Lsg1Q3UM18 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Lsg1Q3UM18 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Lsg1Q3UM18 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lsg1Q3UM18 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Lsg1Q3UM18 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Lsg1Q3UM18 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsg1Q3UM18 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Lsg1Q3UM18 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Lsg1Q3UM18 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lsg1Q3UM18 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Lsg1Q3UM18 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Lsg1Q3UM18 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Lsg1Q3UM18 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lsg1Q3UM18 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Lsg1Q3UM18 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsg1Q3UM18 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsg1Q3UM18 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsg1Q3UM18 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Lsg1Q3UM18 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsg1Q3UM18 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsg1Q3UM18 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lsg1Q3UM18 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lsg1Q3UM18 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms