Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc33Q3ULW6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc33Q3ULW6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc33Q3ULW6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Ccdc33Q3ULW6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc33Q3ULW6 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc33Q3ULW6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc33Q3ULW6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc33Q3ULW6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc33Q3ULW6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc33Q3ULW6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Ccdc33Q3ULW6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc33Q3ULW6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Ccdc33Q3ULW6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ccdc33Q3ULW6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc33Q3ULW6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc33Q3ULW6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ccdc33Q3ULW6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc33Q3ULW6 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Ccdc33Q3ULW6 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Ccdc33Q3ULW6 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Ccdc33Q3ULW6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ccdc33Q3ULW6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Ccdc33Q3ULW6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Ccdc33Q3ULW6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc33Q3ULW6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc33Q3ULW6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Ccdc33Q3ULW6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc33Q3ULW6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc33Q3ULW6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc33Q3ULW6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc33Q3ULW6 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc33Q3ULW6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc33Q3ULW6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc33Q3ULW6 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc33Q3ULW6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc33Q3ULW6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc33Q3ULW6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc33Q3ULW6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc33Q3ULW6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc33Q3ULW6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc33Q3ULW6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc33Q3ULW6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc33Q3ULW6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc33Q3ULW6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc33Q3ULW6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc33Q3ULW6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc33Q3ULW6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc33Q3ULW6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Ccdc33Q3ULW6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc33Q3ULW6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc33Q3ULW6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc33Q3ULW6 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc33Q3ULW6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc33Q3ULW6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc33Q3ULW6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ccdc33Q3ULW6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc33Q3ULW6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc33Q3ULW6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc33Q3ULW6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms