Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM0

Ccdc106, Coiled-coil domain-containing protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc106Q3ULM0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc106Q3ULM0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ccdc106Q3ULM0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc106Q3ULM0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ccdc106Q3ULM0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc106Q3ULM0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc106Q3ULM0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc106Q3ULM0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ccdc106Q3ULM0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc106Q3ULM0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ccdc106Q3ULM0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc106Q3ULM0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc106Q3ULM0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc106Q3ULM0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc106Q3ULM0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc106Q3ULM0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ccdc106Q3ULM0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms