Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Gpr55Q3UJF0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gpr55Q3UJF0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gpr55Q3UJF0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gpr55Q3UJF0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpr55Q3UJF0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gpr55Q3UJF0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gpr55Q3UJF0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gpr55Q3UJF0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gpr55Q3UJF0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gpr55Q3UJF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Gpr55Q3UJF0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gpr55Q3UJF0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Gpr55Q3UJF0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms