Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Arfgef3Q3UGY8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Arfgef3Q3UGY8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Arfgef3Q3UGY8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfgef3Q3UGY8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Arfgef3Q3UGY8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Arfgef3Q3UGY8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef3Q3UGY8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Arfgef3Q3UGY8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgef3Q3UGY8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Arfgef3Q3UGY8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Arfgef3Q3UGY8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Arfgef3Q3UGY8 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Arfgef3Q3UGY8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Arfgef3Q3UGY8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Arfgef3Q3UGY8 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef3Q3UGY8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Arfgef3Q3UGY8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Arfgef3Q3UGY8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfgef3Q3UGY8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Arfgef3Q3UGY8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Arfgef3Q3UGY8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef3Q3UGY8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Arfgef3Q3UGY8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef3Q3UGY8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Arfgef3Q3UGY8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Arfgef3Q3UGY8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Arfgef3Q3UGY8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfgef3Q3UGY8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfgef3Q3UGY8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Arfgef3Q3UGY8 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Arfgef3Q3UGY8 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfgef3Q3UGY8 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Arfgef3Q3UGY8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Arfgef3Q3UGY8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Arfgef3Q3UGY8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Arfgef3Q3UGY8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Arfgef3Q3UGY8 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Arfgef3Q3UGY8 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arfgef3Q3UGY8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arfgef3Q3UGY8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms