Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rrp36Q3UFY0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp36Q3UFY0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp36Q3UFY0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp36Q3UFY0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp36Q3UFY0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rrp36Q3UFY0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Rrp36Q3UFY0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp36Q3UFY0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp36Q3UFY0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rrp36Q3UFY0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rrp36Q3UFY0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rrp36Q3UFY0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp36Q3UFY0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rrp36Q3UFY0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rrp36Q3UFY0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rrp36Q3UFY0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rrp36Q3UFY0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp36Q3UFY0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rrp36Q3UFY0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rrp36Q3UFY0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp36Q3UFY0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rrp36Q3UFY0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrp36Q3UFY0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rrp36Q3UFY0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rrp36Q3UFY0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Rrp36Q3UFY0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rrp36Q3UFY0 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rrp36Q3UFY0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Rrp36Q3UFY0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms