Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc174Q3U155 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Ccdc174Q3U155 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc174Q3U155 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
Ccdc174Q3U155 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.95■■■□□ 2.39
Ccdc174Q3U155 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Ccdc174Q3U155 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Ccdc174Q3U155 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Ccdc174Q3U155 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc174Q3U155 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Ccdc174Q3U155 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc174Q3U155 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Ccdc174Q3U155 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc174Q3U155 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Ccdc174Q3U155 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Ccdc174Q3U155 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Ccdc174Q3U155 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc174Q3U155 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Ccdc174Q3U155 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc174Q3U155 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Ccdc174Q3U155 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc174Q3U155 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc174Q3U155 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Ccdc174Q3U155 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc174Q3U155 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Ccdc174Q3U155 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
Ccdc174Q3U155 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Ccdc174Q3U155 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ccdc174Q3U155 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Ccdc174Q3U155 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Ccdc174Q3U155 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc174Q3U155 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Ccdc174Q3U155 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Ccdc174Q3U155 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc174Q3U155 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc174Q3U155 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc174Q3U155 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Ccdc174Q3U155 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc174Q3U155 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Ccdc174Q3U155 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Ccdc174Q3U155 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc174Q3U155 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc174Q3U155 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Ccdc174Q3U155 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ccdc174Q3U155 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Ccdc174Q3U155 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Ccdc174Q3U155 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Ccdc174Q3U155 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Ccdc174Q3U155 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Ccdc174Q3U155 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc174Q3U155 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc174Q3U155 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc174Q3U155 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Ccdc174Q3U155 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Ccdc174Q3U155 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc174Q3U155 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Ccdc174Q3U155 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc174Q3U155 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Ccdc174Q3U155 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms