Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZ87

March9, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH9, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March9Q3TZ87 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
March9Q3TZ87 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
March9Q3TZ87 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
March9Q3TZ87 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
March9Q3TZ87 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
March9Q3TZ87 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
March9Q3TZ87 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.56■■■□□ 2
March9Q3TZ87 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
March9Q3TZ87 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
March9Q3TZ87 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
March9Q3TZ87 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
March9Q3TZ87 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
March9Q3TZ87 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
March9Q3TZ87 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
March9Q3TZ87 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
March9Q3TZ87 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
March9Q3TZ87 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
March9Q3TZ87 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
March9Q3TZ87 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
March9Q3TZ87 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
March9Q3TZ87 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
March9Q3TZ87 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
March9Q3TZ87 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
March9Q3TZ87 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
March9Q3TZ87 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
March9Q3TZ87 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
March9Q3TZ87 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
March9Q3TZ87 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
March9Q3TZ87 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
March9Q3TZ87 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
March9Q3TZ87 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
March9Q3TZ87 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
March9Q3TZ87 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
March9Q3TZ87 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
March9Q3TZ87 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
March9Q3TZ87 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
March9Q3TZ87 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
March9Q3TZ87 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
March9Q3TZ87 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
March9Q3TZ87 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
March9Q3TZ87 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
March9Q3TZ87 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
March9Q3TZ87 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
March9Q3TZ87 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
March9Q3TZ87 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
March9Q3TZ87 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
March9Q3TZ87 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
March9Q3TZ87 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
March9Q3TZ87 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
March9Q3TZ87 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
March9Q3TZ87 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
March9Q3TZ87 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms