Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Tamm41Q3TUH1 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Tamm41Q3TUH1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tamm41Q3TUH1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tamm41Q3TUH1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tamm41Q3TUH1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tamm41Q3TUH1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tamm41Q3TUH1 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Tamm41Q3TUH1 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Tamm41Q3TUH1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tamm41Q3TUH1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tamm41Q3TUH1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Tamm41Q3TUH1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tamm41Q3TUH1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tamm41Q3TUH1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tamm41Q3TUH1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tamm41Q3TUH1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms