Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUD9

Tmem18, Transmembrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem18Q3TUD9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tmem18Q3TUD9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem18Q3TUD9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tmem18Q3TUD9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem18Q3TUD9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem18Q3TUD9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem18Q3TUD9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tmem18Q3TUD9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Tmem18Q3TUD9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tmem18Q3TUD9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tmem18Q3TUD9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem18Q3TUD9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tmem18Q3TUD9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tmem18Q3TUD9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem18Q3TUD9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem18Q3TUD9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tmem18Q3TUD9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms